陽明山の固有種植物（シダ類を含まない）は162種あり、62科126属に分けられます。そのうち双子葉が53科93属116種、単子葉が9科33属46種です。
動物は鳥類2種、魚類2種、哺乳類3種、爬虫類7種、両生類種、昆虫が種以上です。