行政院農業委員會畜產試驗所花蓮種畜繁殖場（以下簡稱花蓮場）是臺灣重要的水牛保種基地，於民國70至73年間進行收購引進水牛飼養，並於民國76年正式成為國家級保種族群。花蓮場主要任務為水牛品種選育、種原維護與繁殖推廣，近年來以水牛遺傳資源、自動化飼養管理及氣候變遷等相關議題進行研究。水牛在飼養上對環境適應能力強，包括對氣候與地形適應範圍廣及耐粗飼，花蓮場水牛放牧地約20公頃，水牛多以自然、原始、近乎野放的方式飼養。花蓮場歡迎擎天崗水牛群移置飼養，在經過一個月之健康觀察無虞和疾病檢驗（口蹄疫和牛結核病）後，將場區較温馴母牛混養擎天崗水牛，逐漸併入花蓮場原始水牛族群或自成一族群，進行後代繁衍，可增加水牛群之基因多樣性並延續擎天崗水牛群之血統。