一、陽明山國家公園設有磺嘴山、鹿角坑及夢幻湖等3處生態保護區,為保護生物多樣性及供學術研究而應嚴格保護之天然生物社會及其生育環境之地區。
二、依照規定進入生態保護區者,應經國家公園管理處之許可。所以欲進入生態保護區需向本處提出申請,申請網址:生態保護區入園申請系統經許可後,持許可文件依照核准路線及時間進出生態保護區。
三、目前本處僅接受鹿角坑(區分為楓林瀑布區、小觀音山區)、磺嘴山生態保護區之申請,受理申請的人數為平日各開放六十人,假日各開放一百人供民眾申請,每隊以十二人為限。
四、夢幻湖生態保護區因設置有觀景平臺,民眾可以在觀景平臺近距離欣賞夢幻湖,為避免湖區受到干擾,湖區僅接受研究人員及管理人員進入。
五、小觀音山西峰恰位於生態保護區邊界,由鞍部停車場步行經過山之家後,取左線至小觀音山西峰路段,並不屬於生態保護區範圍,故不用申請。由西峰繼續往西西峰或其他地區之路段,則將進入生態保護區,請至本處線上申辦系統完成申請後,方可進入。