本處依衛生福利部訂定菸害防制法第19條第1項第4款，公告自103年4月1日施行「國家公園、國家自然公園、風景特定區及森林遊樂區之指定區域，除吸菸區外，不得吸菸；未設吸菸區，全面禁止吸菸之場所」規定，於本園遊客較多之遊憩區設置「吸菸區」外，其餘園區全面禁止吸菸。
為維護國民健康並尊重抽菸者權益，衛生福利部已於103年3月4日正式公告陽明山國家公園範圍內之小油坑、二子坪、大屯自然公園遊憩區……等12個場所為吸菸區外全面禁菸之地點，並自103年4月1日起生效，請癮君子至指定範圍內吸菸，以免受罰。
陽明山國家公園吸菸區設置表：