陽明山國家公園區內野生動物資源豐富，如遇野生動物受傷或迷途誤入民宅，多由熱心遊客或園區居民通報本處派員前往處理。倘通報之動物經檢視無受傷情形，則尋求適當地點儘速野放；若有受傷急需治療者，則依動物種類轉送其他單位協同處理，如鳥類即轉送台北市野鳥學會合作之動物醫院治療，而哺乳動物則轉送木柵動物園，至於流浪家犬、貓則轉送台北市動物保護處照護。
基於關愛自然、尊重生命及為減少人類活動對區內野生動物造成傷害，本處除透過各類環境教育活動與研討會議之機會，加強宣導民眾勿任意擺放獵具捕捉野生動物，或隨處放生破壞生態，及放任寵物進入生態保護區造成疾病傳染等不當行為，並隨時將相關保育訊息放置本處網頁供民眾瀏覽，以推廣民眾共同維護陽明山國家公園美好自然環境的保育觀念。